想象一下, 有那么一瞬间, 你有能力在一天内完成一年的工作.
That is exactly what Harish Vashisth can do, thanks to being awarded access to Anton 2, the world’s fastest supercomputer for biomolecular simulations.
The opportunity to utilize the newest version of the supercomputer for two-plus days is something researchers dream of, according to Vashisth, an assistant professor of chemical engineering. 他估计，这台机器将产生相当于利用主要研究超级计算机资源两年的结果.
“世界上没有其他机器具有这种生物分子模拟能力,瓦希什说, 他也是 awarded access to another major computational resource -位于圣地亚哥超级计算中心的彗星超级计算机. “使用Anton，我们将能够在短短几天内生成我们将使用和分析几年的数据.”
Vashisth的提议旨在模拟激素胰岛素途径中最大和最重要的蛋白质之一的动力学, the insulin receptor. 这些蛋白质是糖尿病等主要健康风险的核心因素. 这项研究的数据可能会导致设计新的糖尿病疗法和治疗方法.
“我们的目标是做预测科学，预测蛋白质的功能，”Vashisth说 2016年职业成就奖 winner from the National Science Foundation. “This is all about ambitious simulations.”
Vashisth was granted access to the supercomputer, located at the University of Pittsburgh, 通过由国家研究委员会牵头的竞争性研究提案程序. 首先评估提案的技术可行性，然后根据研究的科学价值进行排名, 证明所要求的资源和调查员的资格和成就. 被选中的提案必须清楚地说明，进入安东2号将如何促进科学突破.
今年晚些时候，Vashisth将从主要研究远程访问计算机. Returning principal investigators, who make up to 75 percent of those utilizing Anton 2, receive access to the supercomputer first.
To prepare for access to the computer, 三年级博士生侯赛因·穆罕默德·迪亚拉尼前往匹兹堡, 宾西法尼亚, 参加11月为期一天的研讨会，以测试Anton 2的模拟. 该研讨会还允许Mohammadiarani成功地将数据转换为与Anton 2的模拟软件兼容.
“The instructors were very knowledgeable,” says Mohammadiarani, 期望协助研究计划的六名学生之一. “如果我们有任何错误，他们能够解决问题并继续前进.”
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写的:
布鲁克斯帕耶特 | College of Engineering and 物理科学
